Linda Peniel a une grande expérience de travail sur la fièvre de la vallée du Rift (FVR) et la trypanosomiase, en particulier sur la dynamique de la transmission. La FVR, qui touche à la fois les humains et le bétail, est moins étudiée malgré ses effets dévastateurs sur la société. Linda Peniel a réussi à mettre au point un test sérologique qui permet de différencier les animaux infectés naturellement des animaux vaccinés. Elle a également testé l'immunogénicité et la sécurité du nouveau vaccin contre la FVR sur le cheptel tanzanien.  La plupart de ses observations critiques ont été publiées et présentées dans des conférences internationales aux parties prenantes et aux décideurs politiques.